วันที่ 1 ตุลาคม 2527 จัดตั้งขึ้นตามประกาศกระทรวงศึกษาธิการ ฉบับลงวันที่ 18  ตุลาคม 2527     ให้ยุบรวมโรงเรียนฝึกฝนอาชีพเคลื่อนที่ 47 โรงเรียนผู้ใหญ่สายสามัญ จำนวน 11  แห่ง ห้องสมุดประชาชนอำเภอและห้องสมุดประชาชนจังหวัด จัดตั้งเป็น “ศูนย์การศึกษานอกโรงเรียนจังหวัดนครปฐม”   สังกัด กรมการศึกษานอกโรงเรียน โดยใช้อาคารของโรงเรียนวัดห้วยจรเข้วิทยาคม เป็นที่ทำการชั่วคราว

พ.ศ. 2528 วัดธรรมศาลา โดยคณะกรรมการวัด ได้อนุญาตให้ใช้ที่ดินของวัด เนื้อที่ประมาณ 15 ไร่เศษ เป็นสถานที่ตั้งที่ทำการ

พ.ศ. 2529 กรมการศึกษานอกโรงเรียนได้จัดสรรงบประมาณ ให้ก่อสร้างอาคารอำนวยการ อาคารโรงฝึกงาน อาคารพัสดุ และหอประชุมโรงอาหาร

วันที่ 30 มกราคม พ.ศ. 2530 ได้ย้ายที่ทำการมาปฏิบัติงานที่วัดธรรมศาลา จนถึงปัจจุบัน ต่อมาได้เปลี่ยนชื่อ เป็น “สำนักงานส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยจังหวัดนครปฐม” ตามพระราชบัญญัติส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย พ.ศ. 2551 มีผลบังคับใช้ เมื่อวันที่ 4  มีนาคม 2551 โดยใช้ชื่อย่อว่า “สำนักงาน กศน.จังหวัดนครปฐม” สังกัดสำนักงานส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย สำนักงานปลัดกระทรวงศึกษาธิการ มีบทบาทหน้าที่ ภารกิจในการส่งเสริม สนับสนุน และบริหารจัดการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยในจังหวัดนครปฐม

กระทั่งวันที่ 18 มีนาคม พ.ศ. 2566 ราชกิจจานุเบกษาได้เผยแพร่ พระราชบัญญัติส่งเสริมการเรียนรู้ พ.ศ. 2566 โดยมีสาระสำคัญคือการยกเลิกพระราชบัญญัติส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย พ.ศ. 2551 และยกฐานะ สำนักงานส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย เป็น “กรมส่งเสริมการเรียนรู้” โดยให้มีผลบังคับใช้เมื่อพ้นไป 60 วันหรือตรงกับวันที่ 18 พฤษภาคม พ.ศ. 2566 ทำให้ สำนักงานส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยจังหวัดนครปฐม เปลี่ยนชื่อเป็น “สำนักงานส่งเสริมการเรียนรู้ประจำจังหวัดนครปฐม” โดยมีชื่อย่อว่า “สำนักงาน สกร.ประจำจังหวัดนครปฐม” ตามพระราชบัญญัติฉบับนี้